La Facultad de Ciencias Veterinarias inició sus labores académicas en el año 1956, como escuela de la Facultad de Ingeniería Agrícola y Medicina Veterinaria, se erigió en Facultad por resolución del H. Consejo Universitario el 30 de julio de 1968. Inició sus actividades como tal desde el 23 de octubre del mismo año, fecha en la que se constituyó la primera Honorable Junta de Facultad que eligió y posesionó al Dr. Baudilio Delgado Robles como primer Decano.
Forman parte de la Facultad de Ciencias Veterinarias: La Escuela de Medicina Veterinaria y la Escuela de Acuicultura (Extensión Bahía de Caráquez).
Para el cumplimiento de sus actividades específicas y objetivos institucionales, la Facultad cuenta con departamentos de apoyo a la docencia, investigación, vinculación, producción de bienes y servicios, de diagnóstico y clínica con relación a las diferentes especies animales.
El avance tecnológico, el desarrollo de la explotación acuícola en cautiverio, demandan una actualización continua en la capacitación de profesionales.
En este contexto la Universidad Técnica de Manabí, en procura de satisfacer las justas aspiraciones de la comunidad del cantón Sucre, esto es, contar con un centro universitario para capacitar a sus bachilleres en el campo de la Acuicultura y otras ramas técnicas, crea el 19 de diciembre de 1984 el Instituto de Tecnologías Medias, que funcionaría en Bahía de Caráquez, ciudad comercial, pesquera por tradición, que sostiene parte de la producción nacional de camarón en cautiverio.
Ejerciendo las funciones de Rector el Ing. Guido Arroyo Muentes, el H. Consejo Universitario en sesión de 27 de febrero de 1985, aprueba el proyecto de reformas a la creación del Instituto de Tecnologías Medias, adscrito a la Facultad de Ciencias Matemáticas, Físicas y Químicas, el mismo que funcionaría en la ciudad de Bahía de Caráquez, dejando constancia de la creación más no todavía del funcionamiento.
El 16 de septiembre de 1987, la Comisión Académica acuerda cambiar la denominación del Instituto por el de Extensión Universitaria adscrita a la Facultad de Ciencias Matemáticas, Físicas y Químicas, con su especialidad de Acuicultura, Refrigeración, Electromecánica y otras afines que se crearen en el futuro, la misma que otorgará título universitario a nivel medio, es decir de tecnólogos.
En sesiones extraordinarias de marzo 8 y 9 de 1993, el H. Consejo Universitario, aprueba la separación de los recursos presupuestarios de las Escuelas de Acuicultura y Refrigeración, administradas por la Facultad de Ciencias Matemáticas, Físicas y Químicas, puesto que aceptando la tercera disposición transitoria del presupuesto vigente en 1993, la carrera de Acuicultura se incorpora a la Facultad de Ciencias Veterinarias, en razón de que existe mayor afinidad con las ciencias del mar y esta Facultad.
En 1987, el Instituto empezó a funcionar con el respectivo pensum de estudios para los Tecnólogos en Acuicultura. En 1995 se realizan modificaciones al mismo.
La evolución del sector productivo camaronero y el desarrollo tecnológico contemporáneo, avisora en nuestras Autoridades la necesidad de implementar el sistema semestral como una herramienta para optimizar la enseñanza, promoviendo la formación de profesionales competitivos.
En 1998, la Escuela plantea reformar y ampliar el plan de estudios vigente, para ofrecer al estudiante egresado la posibilidad de obtener el grado académico de Licenciado en Acuicultura, a más del de Tecnólogo que también otorga. Discutido y aprobado por el H. Consejo Universitario en sesiones del 16 de abril de 2001 y del 23 de junio de 2003.
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